左右侧结肠癌与直肠癌克隆演化的比较分析
肿瘤演化是一个动态而复杂的过程，生长模式的差异显著影响疾病进展和治疗结局。在我们发表于 iScience 的最新研究中，我们利用对 68 例结直肠癌（CRC）患者 206 个肿瘤区域的高深度全外显子组测序（WES），解析了不同肿瘤位置——右侧结肠癌（RCC）、左侧结肠癌（LCC）和直肠癌（RC）——的瘤内异质性（ITH）和克隆演化。通过将演化洞见与遗传证据相结合，我们分析了涉及淋巴结（LN）和结外肿瘤沉积（ENTD）的转移途径，揭示了不同的肿瘤发展模式。
主要发现
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RCC、LCC 和 RC 之间的不同演化途径： 我们的研究发现，与 RCC 相比，LCC 和 RC 肿瘤具有更高的复杂性和分化度。通过系统发育树分析，我们在 LCC 和 RC 中观察到更多的分支演化，提示更高的遗传变异性和适应性。
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肿瘤转移与多克隆性： 虽然 LN 和 ENTD 此前被认为具有共同起源，但我们的发现表明，两种转移灶均起源于不同的克隆。此外，ENTD 的演化晚于 LN 转移，为未来的 TNM 分期分类提供了重要区分。
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遗传特征与关键驱动事件： 突变分析揭示了RC 中更高的瘤内异质性（ITH），与 RCC 相比克隆突变更少。APC、TP53 和 KRAS 等关键肿瘤驱动基因被确认为肿瘤发生的早期事件，而 SMAD4 改变主要在转移灶中检测到。
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平行演化与肿瘤进展： 通过检测镜像亚克隆等位基因失衡（MSAI）事件，我们鉴定了平行演化的案例，突出了影响 CRC 进展的趋同突变途径。
思考
形态发生是一个基本的生物学过程，对称性构成大多数结构发育的基础。然而，不对称性——尤其是双侧对称器官中的细微变异——常常出现。在疾病病理学中，这种不对称性可以放大关键差异，为审视肿瘤进展和异常生长提供独特视角。
许多既往研究表明，不对称的肿瘤发展可以成为识别驱动疾病发生和进展的关键因素的宝贵工具，尤其是在相似的遗传背景下。通过系统研究 CRC 亚型间的演化分化，并绘制与肿瘤不对称性相关的遗传变异，我们朝着完善精准医学方法迈出了关键一步。
这项研究由青岛疾病研究组的关键成员 Santasree Banerjee 主导，体现了我们通过协作、高分辨率测序策略揭示癌症演化基因组复杂性的承诺。
本研究的全文可在 iScience 在线获取。