新论文揭示小鼠心脏发育的时空图谱
我们激动地宣布，XinLab 在 GigaScience（2025 年，第 14 卷）上发表了一篇新论文，题为“通过时空转录组测序探索小鼠心脏发育的细胞和分子基础”。该研究由刘心和王继征（阜外医院）领导，康敬敏、李清松等人参与贡献，标志着在理解心脏发育和再生方面迈出了重要一步。
为什么重要
心脏是一个复杂的器官，解开其发育的秘密可能为心脏病的新疗法铺平道路。小鼠很独特，因为与人类不同，它们的心脏在出生后不久可以再生。通过研究这一过程，我们旨在揭示有朝一日能启发再生疗法的机制。我们的研究使用尖端的 Stereo-seq 技术绘制发育中小鼠心脏的基因表达图谱，揭示细胞和分子如何随时间变化。
主要发现
利用空间转录组学，我们创建了小鼠心脏发育在四个时间点的综合图谱：胚胎第 20 天（E20）、出生后第 1 天（P01）、第 4 天（P04）和第 14 天（P14）。以下是我们发现的：
- 细胞景观：鉴定了 14 种不同的细胞类型，其中心室心肌细胞（57%）和心房心肌细胞（21%）占主导。随时间推移，心室细胞增加，而心房细胞和成纤维细胞减少。
- 细胞互作：发现随着心脏成熟，细胞间互作减弱，与胶原蛋白和胰岛素样生长因子等信号减少相关，可能与其再生能力丧失有关。
- 再生洞见：定位了 Igf2 和转录因子 Plagl1 等基因是早期心脏再生的关键参与者，并通过定量 PCR 验证。这些可能成为未来研究的靶点。
- 心房不对称性：发现了 Pitx2 和 Bmp10 等驱动左右心房差异的基因，这些差异对心脏功能至关重要。
XinLab 的贡献
这项研究反映了 XinLab 推动计算生物学和心脏病学边界的使命。刘心作为研究的资深作者，指导团队利用空间组学绘制心脏分子动态图谱。康敬敏和李清松在数据分析和实验中发挥了关键作用，并与阜外医院的王继征等专家合作。在我们的成员页面了解这项工作的完整团队！
深入了解
- 阅读论文：在 GigaScience 访问完整研究此处。
- 探索数据：原始数据可在 NCBI SRA（PRJNA1148773）获取，处理数据在 CNGBdb（5170000062），支持材料在 GigaDB（10.5524/102645）。
- 了解更多：参见这篇 Cell 论文了解 Stereo-seq 的工作原理。
下一步是什么？
该图谱是未来心脏再生和疾病研究的基础。我们已经在探索新的时间点和功能验证，以在这些发现的基础上继续推进。敬请关注更新，与我们一起解开心脏的奥秘！
由 XinLab 于 2025 年 4 月 11 日发布