近期发表在《自然》（Nature）杂志上的一项研究报道了一种改良的测序方法，能够更灵敏地检测血浆游离 RNA（cfRNA）。

灵敏检测 cfRNA —— RARE-seq 技术

✨ 方法学创新

🔬 优化的 cfRNA 分析流程

RARE-seq 是一套精细化的 cfRNA 分析方案，涵盖了从血浆样本处理、cfRNA 提取、文库构建到高通量测序的全流程。该方法旨在显著提升循环肿瘤 RNA（ctRNA）的检测灵敏度。

🩸 解决血小板污染问题

RARE-seq 首次揭示了血小板污染对 cfRNA 分析的巨大影响。研究团队开发了一种计算方法，能够有效去除血小板 RNA 的干扰，确保更准确地检测非血小板来源的基因表达。

🎯 针对低丰度基因的定向捕获

RARE-seq 创新性地设计了针对健康人血浆中稀有或缺失转录本（RAGs）的捕获策略。这使得该技术能够高效检测来源于非造血组织的基因，为识别癌症特异性和器官特异性基因提供了强有力的工具。

🚀 技术优势

🔍 极高灵敏度

与传统的全转录组 RNA 测序相比，RARE-seq 将肿瘤来源 cfRNA 的检测灵敏度提高了 约 50 倍，检测限低至 0.05%。这使得从血液中精准识别极微量的肿瘤相关 cfRNA 成为可能。

🎯 卓越的特异性

RARE-seq 能够有效将肿瘤来源的 cfRNA 与背景 cfRNA 区分开来，显著减少假阳性结果，提高检测准确性。

🛠 强大的抗噪能力

通过优化实验步骤和计算方法，RARE-seq 成功消除了血小板污染和背景噪音，增强了信号清晰度和结果的可信度。

🔬 广泛的适用性

RARE-seq 不仅限于癌症检测，在组织来源鉴定、治疗耐药监测以及非恶性疾病评估方面也展示了巨大潜力。

🔑 核心研究结果

🧪 非小细胞肺癌（NSCLC）检测

在 437 份血浆样本 的测试中，RARE-seq 高效检测到了 NSCLC 的转录特征。检测灵敏度随病程进展而增加，在 IV 期患者中达到 83% 的灵敏度 和 95% 的特异性，表现优于初期的循环肿瘤 DNA（ctDNA）分析。

📌 组织来源鉴定

通过对胰腺癌、前列腺癌和肝癌患者的分析，证实了 RARE-seq 在多种癌症类型中的有效性。其组织起源鉴定的准确率高达 89%。

🔬 治疗耐药监测

在携带 EGFR 突变 的 NSCLC 患者中，RARE-seq 成功检测到了组织学转化和基于突变的耐药机制，为临床医生提供了更全面的耐药信息。

🩺 非恶性疾病评估

RARE-seq 识别出了 慢性阻塞性肺疾病（COPD）、新冠肺炎（COVID-19） 患者以及 ICU 收治患者 的肺源性 cfRNA 表达，展示了其评估非恶性肺部状况的潜力。

💡 临床应用前景

🔎 癌症早期筛查

凭借极高的灵敏度，RARE-seq 有望用于癌症早期检测，特别是针对那些传统影像学方法难以发现的微小肿瘤。

🏥 寻找原发灶

对于原发灶不明的肿瘤患者，RARE-seq 能够通过非侵入性手段鉴定肿瘤的组织来源，提升临床诊断的精准度。

💊 疗效监测与预后评估

通过实时追踪 ctRNA 的变化，RARE-seq 有助于早期发现耐药机制，从而及时调整个性化治疗方案。

🩺 非恶性疾病管理

RARE-seq 可用于监测组织损伤和炎症、评估疾病活动度及治疗反应，为非恶性疾病的诊治提供新视角。

🦠 RNA 疫苗追踪

在接种 mRNA 新冠疫苗的个体中，RARE-seq 能够同时追踪疫苗 RNA 和宿主免疫反应，为 RNA 疫苗的研发和应用提供宝贵数据。