解析毛竹快速生长奥秘：首个居间分生组织单细胞时空图谱
我们近期的研究发表于《美国国家科学院院刊》（PNAS），通过空间转录组技术首次揭示了毛竹居间分生组织的细胞异质性及其驱动快速生长的调控网络。
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赫里科尼亚属植物高度保守的叶绿体基因组图谱揭晓
我们非常高兴地宣布，XinLab 在《植物科学前沿》（Frontiers in Plant Science，2025年第15卷）上发表了题为“Unveiling the Conserved Nature of Heliconia Ch...
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单细胞多组学研究揭示大莎草C3/C4光合作用切换的分子机制
我们近期的研究揭示了大莎草（Eleocharis baldwinii）如何通过环境触发的顺式调控变化，在C3和C4光合模式之间进行灵活切换。
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定位鹰嘴豆耐旱性：基于 MAGIC 群体全基因组重测序的见解
在与 Rajeev Varshney 博士持续进行的长期合作中，我们的团队在理解和增强鹰嘴豆（Cicer arietinum）的耐旱性方面又向前迈进了一步。我们最近发表在《植物基因组》（The Plant Genome）上的研究，利用...
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鹰嘴豆属“超泛基因组”研究：为品种改良提供新见解
2024 年 5 月 23 日，一项发表在《自然·遗传学》（Nature Genetics）在线版的研究展示了 8 个鹰嘴豆野生近缘种的基因组以及鹰嘴豆属（Cicer）的超泛基因组，为作物改良提供了重要资源。
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基于白藤叶绿体基因组的棕榈藤系统发育研究
由 Zhang 等人发表在《BMC Genomic Data》上的最新研究，首次提供了重要棕榈藤物种——白藤（Calamus tetradactylus）的完整叶绿体基因组序列，揭示了其基因组特征及其在棕榈科（Arecaceae）中的...
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全面的鹰嘴豆遗传变异图谱：来自 3,366 份基因组的见解
鹰嘴豆（Cicer arietinum）是世界上最重要的豆类作物之一，长期以来一直是农业基因组学研究的焦点。在与 Rajeev Varshney 教授团队最新的合作研究中，我们对 3,366 份鹰嘴豆资源进行了全基因组测序，构建了迄今...
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揭示毛竹的遗传多样性：一项群体基因组学研究
几个世纪以来，竹子一直是中华文化和日常生活中不可或缺的一部分，它不仅是核心的自然资源，更是一种深厚的文化象征。毛竹（Phyllostachys edulis）作为栽培最广泛的竹种，覆盖了广袤的国土，在生态和经济可持续发展中发挥着至关重...
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全球生菜基因组学研究：揭示栽培生菜的驯化历史与遗传多样性
生菜（Lactuca sativa）是全球消费最广泛的叶菜之一，然而其遗传多样性和驯化历史在很大程度上仍未得到充分探索。在发表于《自然·遗传学》（Nature Genetics）的最新研究中，我们对全球收集的 445 份莴苣属（Lac...
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红树林根际真菌基因组见解：理解海岸生态系统中的微生物适应性
红树林是生物多样性最丰富、生态生产力最高的生态系统之一，孕育了大量的植物、动物和微生物。真菌，特别是栖息在红树林根际（Rhizosphere）的真菌，在有机物分解、营养循环以及与植物的共生互动中发挥着至关重要的作用。然而，它们的基因组...
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三七染色体级基因组组装与全基因组关联分析研究
三七（Panax notoginseng）是一种具有重要经济和治疗价值的中药材。其活性成分——尤其是三七皂苷——因具有多种药理益处而长期受到研究关注。在发表于《iScience》的最新研究中，我们发布了三七的染色体级基因组组装序列，为...
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红树林物种叶绿体基因组比较研究：系统发育与进化分析见解
红树林生态系统作为陆地与海洋之间的关键环境缓冲带，孕育了许多适应极端海岸条件的独特植物物种。尽管具有重要的生态价值，但红树林物种的叶绿体基因组在很大程度上仍未得到充分探索。在发表于《BioMed Research Internatio...
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红树林质体基因组的谱系特异性进化研究
红树林繁茂于热带及亚热带沿海地区，是连接陆地与海洋生态系统的桥梁。红树植物是由其陆生祖先多次独立进化而来的，这为研究基因组趋同进化与谱系特异性适应提供了绝佳机会。在发表于《植物基因组》（The Plant Genome）的最新研究中，...
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早期分化链型藻类基因组揭示植物陆地化进程
植物从水生向陆生环境的过渡是进化史上一个至关重要的时刻。虽然陆地植物（胚胎植物）已经得到了广泛研究，但与其亲缘关系最近的藻类近亲——链型藻类（Streptophyte algae）——为这一转变提供了关键见解。在发表于《自然·植物》（...
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染色体级橡胶树基因组揭示演化历程与橡胶生物合成机制
橡胶树（Hevea brasiliensis）是天然橡胶的主要来源。作为一种关键的工业原料，天然橡胶目前尚无完全对等的合成替代品。深入了解橡胶产量及植物进化的遗传机制，对于培育抗逆性强、高产的品种至关重要。在发表于《植物细胞》（Mol...
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波罗蜜与面包栗基因组草图：揭示淀粉与糖分代谢机制
波罗蜜（Artocarpus heterophyllus）和面包栗（Artocarpus altilis，又称面包果）是波罗蜜属（Artocarpus）中具有重要经济和营养价值的两个物种。作为热带地区的重要主食作物，其基因组特征对于理...
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红树林真菌多变青霉 HXQ-H-1 的染色体级基因组组装研究
红树林生态系统孕育了种类繁多的微生物，其中真菌在有机物质分解和次级代谢产物生产中发挥着至关重要的作用。在这些真菌中，多变青霉（Penicillium variabile） 是一种广泛分布的子囊菌，因其能够产生具有药物潜力的生物活性化合...
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红茄基因组草图发布：推进抗病性与耐旱性研究
红茄（Solanum aethiopicum，又称非洲茄子）是遍布热带非洲的重要作物，具有极高的营养和药用价值。尽管其地位重要，但与茄科的其他亲缘物种相比，有限的基因组资源减缓了其育种进程。在发表于《GigaScience》的最新研究...
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545 份银杏基因组重测序：揭开“活化石”的进化史
作为地球上最古老的现存植物之一，银杏（Ginkgo biloba） 已生存了超过 2 亿年，在剧烈的环境变迁中保持了强大的生命力。在发表于《自然·通讯》（Nature Communications）的最新研究中，我们发布了全球 51 ...
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429 份鹰嘴豆材料重测序：揭示基因组多样性与驯化历史
鹰嘴豆（Cicer arietinum）是一种极具营养和农业价值的主粮豆类作物。了解其遗传多样性对于作物改良至关重要，尤其是在应对气候挑战的背景下。在发表于《自然·遗传学》（Nature Genetics）的最新研究中，我们对来自 4...
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植物园分子数字化：689 种维管植物的高深度基因组测序研究
基因组测序改变了植物研究，为物种多样性、进化和适应性提供了深刻见解。然而，已完成全基因组测序的植物物种数量仍然有限。在发表于《GigaScience》的最新研究中，我们展示了对采集自中国瑞丽植物园的 689 种维管植物进行的高深度全基...
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芸苔属基因组染色体级比较分析研究
芸苔属（Brassica）物种在农业生产和进化研究中具有重要地位，其基因组受到多倍化事件和广泛结构变异的影响。在发表于《植物分子生物学》（Plant Molecular Biology）的最新研究中，我们发布了黑芥（Brassica ...
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五种非洲“被忽视作物”基因组草图：扩展粮食安全的遗传资源
为了实现全球粮食供应的多样化并增强营养安全，那些未被充分利用的作物——通常被称为“被忽视作物”（Orphan Crops）——提供了一条至关重要的途径。与小麦、水稻和玉米等主要主粮作物不同，这些物种尽管在经济、营养和环境方面具有重要意...
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珍珠粟基因组测序：改良干旱地区农艺性状的重要资源
珍珠粟（Cenchrus americanus）是干旱和半干旱地区（尤其是撒哈拉以南非洲和南亚）超过 9000 万农户的主粮作物。它对极端环境条件的耐受力——如高温、低土壤湿度和有限的降雨——使其成为变暖气候下保障粮食安全的关键作物。...
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西藏药用植物大花红景天基因组草图发布
大花红景天（Rhodiola crenulata）是一种极具价值的药用植物，在中药和藏药中地位显著。它因其药理特性而闻名，包括对心血管健康、抗应激以及抗菌活性的潜在益处。尽管其医学和经济重要性日益增加，但关于该物种的基因组信息此前一直...
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解锁陆地棉基因组图谱，揭示异源四倍体演化奥秘
我们于 2015 年在《Nature Biotechnology》发表的研究，首次组装了高质量的陆地棉（TM-1）参考基因组，为棉花纤维改良和抗性育种提供了核心遗传资源。
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小兰屿蝴蝶兰基因组测序：揭示兰花进化与花部多样性
兰科植物是自然界中多样性最高、最引人入胜的植物家族之一，展现了卓越的花部适应性及生态策略。作为重要的观赏植物，小兰屿蝴蝶兰（Phalaenopsis equestris） 因其独特的形态和超长的花期，长期以来一直被广泛用于育种。在发表...
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比较群体基因组学揭示桃的驯化历史
桃（Prunus persica）是经济和文化价值最高的水果作物之一，其驯化历史可追溯至数千年前。作为一种多年生果树，桃的遗传进化过程与一年生植物有所不同，表现出独特的选择压力和驯化模式。在发表于《基因组生物学》（Genome Bio...
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黄瓜基因组变异图谱：揭示驯化历史与遗传多样性
当今消费的大多数水果都是长期驯化和育种的结果。然而，在许多水果作物中，驯化性状及其群体多样性的遗传基础在很大程度上仍未得到充分探索。在发表于《自然·遗传学》（Nature Genetics）的最新研究中，我们通过对从全球 3,342 ...
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谷子基因组测序：揭示禾本科进化与生物燃料潜力
谷子（Setaria italica，又称粟）是一种具有极高营养价值和历史意义的耐旱作物，早在 8,700 多年前就在中国被驯化。作为生命力最顽强的谷物之一，它是生物燃料研究和植物进化研究的理想模型。尽管谷子在经济和生态上具有重要地位...
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《Nature Genetics》：Maize HapMap2 揭示玉米基因组的复杂多样性
我们于2012年在《Nature Genetics》发表的研究，通过对 103 个玉米品种的大规模测序，构建了当时最详尽的玉米变异图谱，助力解锁野生品种中的优异基因。
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50 份栽培大豆与野生稻重测序：农艺基因鉴定研究
水稻（Oryza sativa）是一种经历了广泛驯化的主粮作物，其表型和生理特征发生了显著变化。了解栽培稻与野生稻之间的遗传差异，是挖掘核心农艺性状基因、优化育种策略以及提升作物产量与抗逆性的关键。在发表于《自然·生物技术》（Natu...
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31 份野生和栽培大豆基因组重测序：揭示遗传多样性与驯化历史
大豆（Glycine max）是全球范围内至关重要的农作物，也是蛋白质和油脂的主要来源。深入了解其遗传多样性和驯化历史，对于优化育种策略和保障农业可持续发展具有重要意义。在发表于《自然·遗传学》（Nature Genetics）的最新...
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